MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus casei LOCK919

Total Repeats: 9716

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021721	TA	3	6	1	6	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021721	GGA	2	6	56	61	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021721	AAAC	2	8	1443	1450	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_021721	GTT	3	9	1494	1502	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021721	CTATTA	2	12	1533	1544	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_021721	TATAT	2	10	1557	1566	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021721	AT	4	8	1563	1570	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021721	AGG	2	6	1582	1587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021721	T	6	6	2871	2876	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021721	T	6	6	2903	2908	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021721	TGA	2	6	2929	2934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021721	TTG	2	6	2948	2953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021721	T	6	6	2978	2983	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021721	AAT	2	6	3064	3069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021721	AGT	2	6	3215	3220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021721	TAAT	2	8	3230	3237	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021721	GAC	2	6	3249	3254	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_021721	TGA	2	6	4676	4681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021721	AGG	2	6	4874	4879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021721	GAG	2	6	6892	6897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021721	TAA	2	6	9534	9539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021721	TTTG	2	8	9615	9622	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021721	TCC	2	6	10347	10352	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_021721	GCAA	2	8	10431	10438	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_021721	AGA	2	6	10445	10450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021721	AGG	2	6	10633	10638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_021721	CGC	2	6	11089	11094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_021721	AGG	2	6	11191	11196	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021721	T	6	6	11510	11515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021721	GGA	2	6	12204	12209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021721	T	7	7	12496	12502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021721	GTA	2	6	12525	12530	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021721	TGA	2	6	12556	12561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021721	CG	3	6	12616	12621	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_021721	ATG	2	6	12624	12629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_021721	AGA	2	6	12671	12676	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021721	AAAT	2	8	12721	12728	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021721	TA	3	6	12808	12813	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_021721	ATT	2	6	12868	12873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021721	GCG	3	9	15385	15393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_021721	AAGG	2	8	15395	15402	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021721	T	7	7	15651	15657	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021721	TAC	2	6	16331	16336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_021721	TGTT	2	8	16337	16344	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021721	GAA	2	6	16380	16385	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021721	AAGC	2	8	16396	16403	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_021721	A	6	6	16431	16436	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021721	TC	3	6	16443	16448	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_021721	A	6	6	16457	16462	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_021721	CAT	2	6	16469	16474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_021721	TTG	2	6	16475	16480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021721	TAA	2	6	16541	16546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021721	TG	3	6	16547	16552	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_021721	AAC	2	6	16603	16608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_021721	ATT	2	6	16662	16667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021721	TAAT	2	8	17163	17170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021721	AT	3	6	17169	17174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021721	AC	3	6	17213	17218	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_021721	CAA	2	6	17653	17658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_021721	TAC	2	6	17681	17686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_021721	AGC	2	6	17733	17738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_021721	A	8	8	17756	17763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021721	CGTT	2	8	17823	17830	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_021721	A	6	6	17832	17837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021721	A	6	6	18726	18731	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_021721	TTC	2	6	18765	18770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_021721	CGC	2	6	19116	19121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_021721	CCT	2	6	19213	19218	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
69	NC_021721	AGCT	2	8	19262	19269	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_021721	TA	3	6	19316	19321	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_021721	ACG	2	6	19396	19401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_021721	CTT	2	6	19619	19624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_021721	GTGAT	2	10	19656	19665	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
74	NC_021721	GGTA	2	8	19683	19690	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_021721	TGA	2	6	21075	21080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_021721	A	6	6	21091	21096	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021721	GAC	2	6	21107	21112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_021721	CCT	2	6	24427	24432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_021721	TG	3	6	24451	24456	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021721	GTTTT	2	10	24651	24660	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_021721	ATG	2	6	24681	24686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_021721	GGA	2	6	24690	24695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021721	ATA	2	6	25277	25282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_021721	GGTT	2	8	26447	26454	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_021721	T	6	6	26466	26471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021721	CATA	2	8	26493	26500	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
87	NC_021721	AGA	2	6	26507	26512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_021721	T	6	6	26556	26561	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021721	GTT	2	6	26572	26577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021721	AGTG	2	8	26639	26646	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021721	TC	3	6	27346	27351	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_021721	CAA	2	6	27395	27400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_021721	T	6	6	27401	27406	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_021721	CAT	2	6	27422	27427	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_021721	AACA	2	8	27446	27453	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
96	NC_021721	GTC	2	6	27491	27496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_021721	GCC	2	6	27539	27544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_021721	TGT	2	6	27572	27577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021721	CTT	2	6	27605	27610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_021721	TA	3	6	27650	27655	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021721	GTT	2	6	27699	27704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_021721	A	7	7	27705	27711	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_021721	TAA	2	6	27719	27724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_021721	AAC	2	6	27759	27764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_021721	CCT	2	6	27777	27782	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_021721	TAT	2	6	29954	29959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021721	TG	3	6	29963	29968	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021721	T	6	6	30030	30035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021721	TGTTTT	2	12	30045	30056	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021721	GGA	2	6	30059	30064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_021721	A	6	6	30111	30116	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_021721	TCA	2	6	30154	30159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_021721	ATAA	2	8	30256	30263	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021721	T	6	6	30269	30274	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_021721	CTC	2	6	31062	31067	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_021721	T	7	7	31148	31154	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_021721	GAA	2	6	31222	31227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_021721	T	6	6	31982	31987	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021721	ATT	2	6	31997	32002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021721	TA	3	6	32031	32036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_021721	T	6	6	32062	32067	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_021721	ACT	2	6	32079	32084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_021721	TA	3	6	32110	32115	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_021721	TGT	2	6	32137	32142	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_021721	GGA	2	6	32169	32174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_021721	TCT	2	6	32405	32410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_021721	ATA	2	6	33257	33262	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_021721	GTA	2	6	33297	33302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_021721	TTG	2	6	33317	33322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130	NC_021721	ATG	2	6	33328	33333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_021721	CGGCA	2	10	33370	33379	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
132	NC_021721	CAA	2	6	35026	35031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_021721	AAGC	2	8	35090	35097	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
134	NC_021721	CA	3	6	35205	35210	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_021721	AGCA	2	8	36596	36603	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_021721	ATTT	2	8	36644	36651	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021721	TCA	2	6	36670	36675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_021721	TA	3	6	36722	36727	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_021721	AG	3	6	37169	37174	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
140	NC_021721	CAA	2	6	37688	37693	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_021721	CAT	2	6	37776	37781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_021721	TTG	2	6	37870	37875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_021721	AAG	2	6	37878	37883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021721	CGA	2	6	37900	37905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_021721	TTG	2	6	37957	37962	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
146	NC_021721	AACTGA	2	12	38126	38137	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
147	NC_021721	GGT	2	6	38210	38215	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
148	NC_021721	GGC	2	6	38346	38351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_021721	GCG	2	6	38361	38366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
150	NC_021721	TGA	2	6	38378	38383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_021721	TA	3	6	40578	40583	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_021721	TGG	2	6	40615	40620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
173	NC_021721	ATT	2	6	40626	40631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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182	NC_021721	AT	3	6	41916	41921	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_021721	CTA	2	6	41962	41967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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185	NC_021721	A	6	6	42002	42007	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_021721	TGC	2	6	42014	42019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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192	NC_021721	TAT	2	6	42259	42264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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267	NC_021721	TTCTTT	2	12	52094	52105	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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276	NC_021721	A	7	7	54850	54856	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_021721	TTG	2	6	54878	54883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
278	NC_021721	ATT	2	6	54926	54931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_021721	TGAA	2	8	55007	55014	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_021721	A	7	7	56560	56566	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_021721	GCT	2	6	56617	56622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
287	NC_021721	TAA	2	6	56623	56628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_021721	TGTTT	2	10	56793	56802	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
289	NC_021721	AAG	2	6	56823	56828	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
290	NC_021721	CTG	2	6	57017	57022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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292	NC_021721	A	6	6	57105	57110	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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436	NC_021721	GAA	2	6	90035	90040	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
437	NC_021721	GCTT	2	8	91351	91358	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
438	NC_021721	AGCAT	2	10	91377	91386	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
439	NC_021721	ATT	2	6	91445	91450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
440	NC_021721	ACA	2	6	91604	91609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
441	NC_021721	CGA	2	6	91785	91790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
442	NC_021721	GA	3	6	91789	91794	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
443	NC_021721	CCT	2	6	93492	93497	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
444	NC_021721	CCCAG	2	10	93510	93519	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
445	NC_021721	ACT	2	6	93604	93609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
446	NC_021721	TAA	2	6	94781	94786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
447	NC_021721	TCC	2	6	96857	96862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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449	NC_021721	CAAA	2	8	96918	96925	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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451	NC_021721	TCA	2	6	97067	97072	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
452	NC_021721	GTTG	2	8	97103	97110	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
453	NC_021721	TAA	2	6	97139	97144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
454	NC_021721	AAAT	2	8	97160	97167	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
455	NC_021721	GA	3	6	97171	97176	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
456	NC_021721	CG	3	6	97286	97291	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
457	NC_021721	GTCT	2	8	97307	97314	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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459	NC_021721	A	6	6	101185	101190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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461	NC_021721	TCA	2	6	101654	101659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
462	NC_021721	AT	3	6	101690	101695	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
463	NC_021721	TAA	2	6	101702	101707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
464	NC_021721	CT	3	6	101746	101751	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
465	NC_021721	TCA	2	6	101765	101770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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467	NC_021721	CAT	2	6	101809	101814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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470	NC_021721	A	7	7	103175	103181	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
471	NC_021721	GCT	2	6	103224	103229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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473	NC_021721	AAAT	2	8	103438	103445	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
474	NC_021721	ATT	2	6	103457	103462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
475	NC_021721	AGA	2	6	103525	103530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
476	NC_021721	ATA	2	6	103593	103598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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479	NC_021721	GAT	2	6	103623	103628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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481	NC_021721	AT	3	6	105282	105287	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
482	NC_021721	TTC	2	6	105361	105366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
483	NC_021721	AAT	2	6	105410	105415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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487	NC_021721	ATA	2	6	105726	105731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_021721	TTGT	2	8	109722	109729	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding

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